Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRBP23467 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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