Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms