Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
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