Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms