Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms