Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms