Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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