Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b2Q9JME5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b2Q9JME5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms