Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF541Q9H0D2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms