Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms