Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc81Q9D5W4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms