Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCMBPQ9BTE3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms