Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q5

Chchd7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd7Q8K2Q5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd7Q8K2Q5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chchd7Q8K2Q5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms