Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GREB1Q4ZG55 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GREB1Q4ZG55 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GREB1Q4ZG55 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GREB1Q4ZG55 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GREB1Q4ZG55 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GREB1Q4ZG55 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GREB1Q4ZG55 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms