Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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