Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
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