Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL9Q07325 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms