Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCAMP43121 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCAMP43121 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCAMP43121 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCAMP43121 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCAMP43121 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCAMP43121 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCAMP43121 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCAMP43121 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCAMP43121 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCAMP43121 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCAMP43121 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCAMP43121 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCAMP43121 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms