Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
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