Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms