Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms