Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGFO15240 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGFO15240 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGFO15240 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VGFO15240 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGFO15240 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
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