Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD1AO15047 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms