Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ssxb8B1AY40 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ssxb8B1AY40 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ssxb8B1AY40 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ssxb8B1AY40 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ssxb8B1AY40 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ssxb8B1AY40 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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