Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem238A9JSM3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms