Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP68Q9UHB9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms