Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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