Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms