Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXL2Q9NZ53 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms