Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms