Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms