Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CICQ96RK0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms