Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGD4Q96M96 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGD4Q96M96 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms