Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms