Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGBL3Q8NEM8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGBL3Q8NEM8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms