Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms