Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms