Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms