Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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CTF1Q16619 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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