Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-1Q15270 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms