Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Atp8b1Q148W0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Atp8b1Q148W0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Atp8b1Q148W0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b1Q148W0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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