Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTR4Q13639 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR4Q13639 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms