Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbx1P82976 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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