Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabpb2P81069 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms