Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFC1P60507 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1P60507 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms