Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK1P57059 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK1P57059 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK1P57059 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK1P57059 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms