Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NF1P21359 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NF1P21359 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NF1P21359 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms