Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5483B2RV77 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms