Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms