Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms